Les fouilles ont commencé en 1997 sous la direction de l'archéologue Yannos Kourayos, et les tranchées au-dessus de la baie de Mandra ont depuis révélé plus de vingt bâtiments, des fragments de kouroi en marbre, des scarabées égyptiens et de la poterie corinthienne. Une croisière à Antiparos et Despotiko traverse à peine un kilomètre de chenal en eau libre pour atteindre ce rivage. Le sanctuaire appartenait à Apollon. Au VIe siècle avant J.-C., il attirait des offrandes de Paros, Naxos, Crète et du Levant, et certains érudits classent sa richesse proche de celle de Délos.
Ce qui rend le sol inhabituel, c'est qu'il s'élève plutôt qu'il ne s'érode. Les conservateurs pratiquent l'anastylose sur le bâtiment A depuis 2012, réélevant des colonnes cannelées et replaçant des architraves à partir de blocs récupérés à quelques mètres de l'endroit où ils sont tombés. Rien n'est couvert, peu est clôturé, et l'entrée coûte 0 EUR, sans frais officiels pour le site archéologique — les billets de croisière à Antiparos et Despotiko couvrent le bateau, pas les pierres. La colonnade debout en 2026 est plus haute que celle photographiée une décennie plus tôt.
La géographie explique la portée du sanctuaire. Despotiko, l'îlot de Tsimintiri et Antiparos formaient autrefois une seule masse terrestre ; la montée des eaux a noyé l'isthme et laissé un chenal peu profond et abrité que les coques antiques pouvaient traverser par presque tous les vents. Ce chenal est toujours la route. La croisière en kaiki à Antiparos et Despotiko suit une eau plus ancienne que les ruines, et la même traversée apparaît sur la croisière à Antiparos et Despotiko à la journée depuis Paros et sur la croisière à Antiparos et Despotiko à la journée qui ajoute Panteronisi et les bas-fonds pâles du Lagon Bleu.
L'architecture récompense une lecture attentive. Le marbre parien, extrait à une courte navigation au nord, à Marathi, côtoie le schiste local grossier, de sorte que le sanctuaire se lit comme deux matériaux en conversation : prestige importé et praticité insulaire. Le hestiatorion — une salle à manger où les fidèles prenaient des repas rituels sur des bancs de pierre — survit comme le plan le plus clair du site, ses blocs de seuil étant encore coupés de trous pour des broches en bronze. À l'ouest, un groupe de magasins contenait des amphores de transport empilées à la verticale dans le sable. Au-delà du bord des fouilles, l'île retourne au thym, aux murs en pierre sèche et aux chèvres. Les croisières à Antiparos et Despotiko ont fait d'un rocher inhabité l'une des fouilles les plus observées des Cyclades, et les archéologues qui y travaillent chaque été sont, pour quelques heures par jour, en infériorité numérique face aux visiteurs arrivés par la mer.